Je kunt pas inloggen in je phpMyAdmin als je in DirectAdmin een database aan hebt gemaakt. Als je dit hebt gedaan kun je via www.jedomein.nl/phpmyadmin of de optie phpMyAdmin in het hoofdscherm van DirectAdmin je database beheren. Je moet hiervoor de inloggegevens van je database of van DirectAdmin invoeren, waarna je in het hoofdscherm van phpMyAdmin komt. Links staan dan de beschikbare databases en tabellen.
Als je vanuit een script vervolgens verbinding wilt maken met je database, moet je als server 'localhost' gebruiken en als gebruikersnaam en wachtwoord de gegevens die je op hebt gegeven bij het aanmaken van de database.